La primera planta la ocupan toda una serie de ostentosos salones, que constituyen la zona principal del palacio, en ella también se encontraba la cocina principal. En la segunda planta se hallan los dormitorios y en una entreplanta una segunda cocina.Foto:jrgcastro
La Capilla Mayor se construyó entre 1549 y 1609, según traza de Jerónimo Quijano, aunque en la dirección de los trabajos participaron otros maestros como Alamiquez, Inglés, Bernardino y Torregrosa. Fue concebida como un módulo autónomo separado del resto de la nave por una estructura en forma de arco de triunfo.Foto:jrgcastro
Consta de un arco apuntado y abocinado con arquivoltas de decoración vegetal, parteluz con la imagen de Santiago y tímpano con los emblemas de los Reyes Católicos; todo ello enmarcado por un alfíz con un friso de arquerías ciegas en su parte superior.Foto:jrgcastro
De entre el patrimonio mueble del edificio destacan el retablo de la Capilla de la Comunión del Siglo XVIII y el de la Capilla de San Antonio (S. XVIII) obra este último de José Caro. Así mismo destacan la imagen de la Virgen del Rosario obra gótica del S. XIV, la urna del monumento, obra de Antoine Dupar (principios del siglo XVIII) y diversos cuadros que decoran el templo obra de Joaquín Campos (S. XVIII) como "el Buen Pastor". Foto:jrgcastro
El presbiterio es de planta cuadrada con gran cúpula sobre pechinas, decoradas con lienzos de Bartolomé Albert. El mismo fue diseñado en estilo renacentista siguiendo las pautas herrerianas por el francés Agustín de Bernaldino, decorando las bóvedas, muros y cúpula con casetonesFoto:jrgcastro